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诱导多能干细胞(iPSC)技术问世以来,干细胞生物学和再生医学取得了巨大进展。人类iPSCs已经广泛的应用在疾病建模、药物发现和细胞治疗开发等研究方向。在药物发现的应用方向中,iPSC被迅速应用于生成人类“培养皿中的疾病”模型,用于基于靶点和表型的药物筛选中。iPSC来源于人体细胞、易于获取、可扩展并且能够分化为几乎任何所需的细胞类型,结合当前火热的细胞和基因治疗、3D细胞及类器官模型的发展,其应用空间及前景巨大。
iPSC衍生细胞应用于药物筛选及疾病模型建立1
由于iPSC衍生细胞需要数周时间进行分化和成熟(例如神经细胞等),如何大规模、稳健、可重复的培养可用于高通量药物筛选的成熟细胞并且对细胞进行多参数长期监测及检测成为一项挑战。随着实验室自动化仪器及系统的发展,实验室自动化系统被应用于细胞培养过程,以解决其培养周期长、质量不稳定、容易污染等问题。
细胞培养流程自动化:
瑞孚迪(Revvity)开发的explorer G3自动化整合系统,可用于工业规模上生产iPSC衍生细胞。该平台具有无菌层流罩,支持384孔板iPSC衍生细胞全自动培养,包括细胞接种、培养基更换、化合物处理以及表型筛选等。iPSC衍生细胞培养过程中利用Celigo及Envision酶标仪对其进行污染、聚团、细胞密度、汇合度等指标的检测。2
Revvity explorer G3自动化整合系统
实验数据信息化:
iPSC衍生细胞的长周期培养及药物处理过程中会产生大量的数据,例如样本信息、化合物信息、细胞成像图片、酶标仪检测数据等等。为了对培养过程中的数据进行收集、追踪及管理,瑞孚迪定制开发了“Database XLII”数据库,实现实验数据信息化。
Database XLII实现数据信息化
数据分析可视化及决策自动化:
对iPSC衍生细胞培养过程中的海量数据进行分析也是一件极具挑战的工作,由于在培养过程中需要数据需要进行整合分析,才能做出正确的决策。例如:iPSC培养过程中的污染及聚团的检测,需要通过细胞成像、孔内浊度及吸光值进行联合判定。为此,瑞孚迪将“Database XLII”数据库与TIBCO Spotfire软件进行对接,将数据上传到TIBCO Spotfire中进行可视化分析, explorer G3自动化整合系统根据分析结果进行决策,对不同的细胞分别进行处理,例如放弃后续试验、继续培养、更换培养基、人工确认等,实现数据分析可视化及决策自动化。
TIBCO Spotfire可视化数据分析
瑞孚迪通过设计、搭建自动化整合系统实现了iPSC衍生细胞的长周期自动化培养并打通数据管理、分析及决策过程的壁垒,为客户提供切实可行的解决方案。
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