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T细胞在免疫监视以及抵御感染和癌症方面发挥着许多关键作用。在过去几十年中,对T细胞功能的深入理解使得人们在癌症免疫治疗、自身免疫疾病和传染病等领域取得了重大突破。近期的突破性进展,包括首个获得美国食品药品监督管理局(FDA)批准的TCR-T疗法以及用于靶向实体瘤和自身免疫疾病的CAR-T细胞的先进设计,预示着T细胞研究的光明前景。
尽管近期技术方面取得了些进步,但研究人员仅仅触及利用T细胞进行治疗的潜力的表面。随着以T细胞为中心的治疗目标不断发展,研究人员需要的工具和技术也在不断演变,以充分理解T细胞。在本博文中,我们将探讨用于T细胞研究的技术趋势,并深入研究这些趋势将如何塑造T细胞研究的未来。
单细胞技术
揭示T细胞异质性的见解
集合(ensemble)和群体(bulk)检测提供了廉价且易于获取的T细胞信息,但群体平均值常常掩盖了在疾病和治疗中具有独特作用的稀有细胞亚群的存在。因此,近期的研究趋势是引入单细胞平台,以提高生物学分辨率并捕捉关于单细胞的关键细节。过去十年中,PubMed中包含“单细胞”作为关键词的条目增加了超过500%,这表明单细胞技术(如单细胞RNA测序、质谱流式细胞术以及多种研究单细胞功能的技术,包括细胞因子分泌、细胞杀伤和代谢组学)正在快速推动研究向前发展。
功能行为学
超越转录组学和基因组学
尽管基因组学和转录组学数据对于理解T细胞生物学至关重要,但越来越清楚的是,仅凭它们无法完整地讲述T细胞行为的全部故事。特别是,mRNA与蛋白质水平之间的相关性已被证明会因多种因素(如细胞亚群和功能状态)而显著变化。鉴于测序的某些局限性,研究正在转向纳入更多功能数据,以直接表征T细胞的活性。功能测定可以测量细胞因子分泌、细胞杀伤和代谢状态等多种数据,提供更全面的T细胞功能视角,并可用于直接评估直接参与免疫反应的T细胞行为。
实时数据
监测T细胞动态
T细胞的功能是动态的,其功能行为(如细胞因子分泌、细胞杀伤和表面标记表达)与激活、持久性和耗竭等结果密切相关。这些行为发生在时间谱上,无法通过依赖单时间点数据的技术(如流式细胞术和单细胞RNA测序)捕捉到。至关重要的是,研究表明,T细胞和工程T细胞的效力可能与快速或慢速细胞杀伤相关,这表明设计有效的细胞治疗可能依赖于动态测量以优化治疗潜力。
T细胞研究有望彻底改变免疫治疗的未来,这需要更先进的工具来充分理解单个细胞的行为并发挥其潜力。一种旨在同时利用所有这些趋势的技术是Beacon®光导微流控平台。Beacon®平台是一种单细胞技术,专注于提供单个细胞实时的功能数据。Beacon®仪器可自动将单个T细胞分离到0.74纳升的NanoPens®小室中,并可进行多种检测以研究单细胞功能。例如,将单个T细胞与靶细胞共培养可以同时展示数千个单细胞的细胞杀伤、细胞因子分泌和表面标记表达能力。在完成检测后,Beacon®仪器还可以回收感兴趣的细胞以进行多组学测序,并揭示功能行为的转录组学驱动因素。
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